抗體表征理化屬性分析
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抗體表征理化屬性分析
抗體藥物是近些年來醫(yī)藥行業(yè)非常熱門的賽道,先從單抗開始,在又相繼開發(fā)了抗體偶聯(lián)藥物、多特異性抗體藥物、納米抗體等多種新興技術(shù)。我們來看看抗體藥物表征之理化屬性分析。
抗體藥物結(jié)構(gòu)
抗體藥物結(jié)構(gòu)表征主要包括以下參數(shù):
1)完整分子量
2)輕鏈分子量化學(xué)
3)重鏈分子量
4)氨基酸序列
5)二硫鍵
6)自由巰基
7)糖基化位點(diǎn)
8)N-端測(cè)序
9)翻譯后修飾
10)二、三級(jí)結(jié)構(gòu)表征
在前9項(xiàng)一級(jí)結(jié)構(gòu)表征中,LC/MS是最主要和最基礎(chǔ)的表征方法,我們基泰推薦THERMO高分辨質(zhì)譜配合液相來做結(jié)構(gòu)分析。高分辨質(zhì)譜通過高分辨、精確質(zhì)量數(shù)測(cè)量和多級(jí)碎片解析,完成復(fù)雜體系成份鑒定和表征,特別適合抗體表征分析。
抗體結(jié)構(gòu)表征的目的,除了全面表征抗體藥物質(zhì)量,另外一個(gè)核心目標(biāo)是尋找可能影響抗體藥物療效的關(guān)鍵氨基酸殘基、關(guān)鍵氨基酸的翻譯后修飾,進(jìn)行相關(guān)工藝改造和確認(rèn),避免在工藝開發(fā)后期以及臨床階段,產(chǎn)生不良影響,主要包括:脫酰胺,異構(gòu)化,Met和Trp氧化,未配對(duì)的半胱氨酸等。
1.1 脫酰胺
天冬酰胺(Asn),尤其是CDR區(qū)的Asn殘基脫酰胺,是單克隆抗體藥物最常遇到的降解途徑之一。當(dāng)Asn后面是小的且活躍的甘氨酸(Gly)殘基(NG基序)時(shí),容易發(fā)生脫酰胺,并且如果發(fā)生在CDR區(qū),會(huì)導(dǎo)致對(duì)抗原結(jié)合親和力降低,抗體效力喪失。因而在抗體測(cè)序和生物信息學(xué)評(píng)估時(shí),需要關(guān)注CDR區(qū)的Asn-Gly殘基,并在強(qiáng)制降解階段對(duì)其進(jìn)行評(píng)估。
此外在IgG的Fc段“ PENNY”環(huán)肽中,也包含脫酰胺易感位點(diǎn),但是因?yàn)橥ǔ2粫?huì)對(duì)抗體藥物結(jié)合抗原帶來負(fù)面影響,一般不做重點(diǎn)關(guān)注。
1.2 氨基酸氧化
蛋氨酸(Met)和色氨酸(Trp)殘基容易發(fā)生氧化。其中重鏈CDR2中的蛋氨酸以及Fc區(qū)中的蛋氨酸氧化并不會(huì)影響抗原結(jié)合。但是當(dāng)氧化水平較高,或者發(fā)生在抗原結(jié)合的關(guān)鍵CDR區(qū)域,會(huì)降低抗原結(jié)合能力,降低抗體藥物的有效性。
靠近CH2-CH3區(qū)域的蛋氨酸殘基易發(fā)生氧化,導(dǎo)致熱穩(wěn)定性下降,聚集增加,補(bǔ)體依賴性細(xì)胞毒性(CDC)下降,與FcRn的結(jié)合親和力下降以及體內(nèi)半衰期縮短。
CDR中Trp殘基的氧化,可能導(dǎo)致有效性降低,熱穩(wěn)定性降低和聚集傾向增加。
總體而言,生物信息學(xué)分析和一級(jí)序列測(cè)定時(shí),應(yīng)重點(diǎn)關(guān)注CDR區(qū)Met和Trp的氧化,并確定它們的敏感性,必要時(shí)在工藝階段采取適度控制策略。
1.3 Asp異構(gòu)化
Asp異構(gòu)化是單克隆抗體藥物的另一種降解途徑。CDR區(qū)的Asp殘基,如果后面是Gly殘基,His或Ser時(shí),通常易于異構(gòu)化。CDR區(qū)發(fā)生異構(gòu)化,可能導(dǎo)致抗原結(jié)合親和力降低。當(dāng)pH值在5左右時(shí),有利于Asp異構(gòu)化,因此抗體藥物的制劑配方開發(fā)時(shí),需要注意其pH值盡可能避開5。
1.4 糖基化位點(diǎn)
IgG CH2 Asn-297連接的N糖為核心7糖結(jié)構(gòu),四個(gè)N-乙酰葡糖胺(GlcNAc)和三個(gè)甘露糖(Mannose)殘基。根據(jù)抗體的功能需要,會(huì)對(duì)抗體的糖型進(jìn)行改造,以獲取相應(yīng)的功能特性,以及延長或縮短抗體半衰期等。因而糖基位點(diǎn)檢測(cè)分析貫穿于抗體藥物工藝的整個(gè)過程,也是質(zhì)量放行的關(guān)鍵質(zhì)量屬性。
抗體糖工程改造主要有巖藻糖基化,乙酰葡糖胺化,半乳糖基化,唾液酸化四種。
通過核心巖藻糖基轉(zhuǎn)移酶(Fut8)催化N-聚糖GlcNAc核心巖藻糖基化;通過乙酰葡糖胺基轉(zhuǎn)移酶3(GNT3)在分支角Mannose上添加乙酰葡糖胺(GlcNAc);通過β-1,4-半乳糖轉(zhuǎn)移酶1(b4GALT1)在七糖末端的兩個(gè)GlcNAc添加半乳糖,使其半乳糖化。這三種策略是改變和1型FcγR的結(jié)合。在核心巖藻糖基化以及半乳糖基化的基礎(chǔ)上,在α2,6-唾液酸轉(zhuǎn)移酶(ST6GAL1),可以增加抗體的唾液酸化,唾液酸化則可以增加和2型FcγR的結(jié)合。
糖異質(zhì)性分析,通常使用LC/MS對(duì)于糖型進(jìn)行鑒定,使用HILIC-FLD進(jìn)行糖型定量分析,使用硼酸親和色譜進(jìn)行糖化檢測(cè)。
1.5 未配對(duì)的半胱氨酸(Cys)殘基
未配對(duì)的半胱氨酸會(huì)增加抗體的異質(zhì)性,并可能對(duì)化學(xué)和熱穩(wěn)定、生物功能、聚體形成,抗原結(jié)合效力和蛋白折疊產(chǎn)生重大影響。單克隆抗體在CDR區(qū)可能具有未配對(duì)的半胱氨酸(Cys)殘基,不過比較少見。未配對(duì)的Cys很容易地在細(xì)胞培養(yǎng)基中被游離的半胱氨酸修飾,會(huì)降低抗原結(jié)合親和力。因此,未配對(duì)的半胱氨酸應(yīng)視為質(zhì)量屬性進(jìn)行常規(guī)監(jiān)測(cè)和表征,以確保結(jié)構(gòu)完整性和產(chǎn)品質(zhì)量。
變異體分析
重組抗體在培養(yǎng)工藝、純化、制劑等階段都容易引入抗體大小變異體和電荷變異體。抗體大小變異體和電荷變異體是抗體鑒別和一致性評(píng)價(jià)的重要指標(biāo)。
大小變異體檢測(cè)常用方法包括分子量排阻色譜,CE-SDS(2015版藥典收錄,2020版做了修訂)。
抗體藥物的電荷變化反映了各種蛋白質(zhì)翻譯后修飾的總和,對(duì)工藝改變的過程非常敏感,在整個(gè)開發(fā)過程中都需要密切監(jiān)測(cè),以確保一致性。常用的表征方法包括離子交換色譜法和等電聚焦法(2020版藥典收錄),檢測(cè)指標(biāo)包括等電點(diǎn)和酸堿變異體。
聚集分析
抗體分子因?yàn)榉g后修飾、運(yùn)輸?shù)鹊募羟辛Α㈦s質(zhì)、pH值變化等引起蛋白質(zhì)空間改變,形成空間互補(bǔ)、電荷互補(bǔ),易產(chǎn)生聚集體。聚集體(或聚集顆粒)是最常見的產(chǎn)品相關(guān)的雜質(zhì)。抗體聚集會(huì)增加抗體藥物免疫原性,促進(jìn)抗藥物抗體產(chǎn)生,降低藥物療效,所以需要進(jìn)行密切監(jiān)控。
常用的分析方法包括:十二烷基硫酸鈉-聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS-PAGE)或毛細(xì)管電泳(CE-SDS),用于在變性條件下還原或非還原下測(cè)定mAb單體,片段和共價(jià)聚集體。體積排阻色譜法(SEC)也是確定單克隆抗體的高分子量聚集物(例如二聚體,三聚體或低聚物)的最常用方法。
對(duì)于大型聚集體(顆粒物),可以使用光散射來表征<1nm至1-10μm范圍內(nèi)的顆粒,比如常用的DLS方法,目前對(duì)于顆粒物,藥典的檢測(cè)方法包括光阻法(例如HIAC)和顯微計(jì)數(shù)法。微流體成像技術(shù),則被用于大于2-100μm的顆粒物,可以一定程度上區(qū)分蛋白質(zhì)聚集顆粒物和其他異物。