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探“云”指南 | 歐易云小提琴圖交互速速mark！
（友情提示：淺色模式觀看效果最佳）
一般來說，小提琴圖是一種繪制連續型數據的方法，可以認為是箱形圖與核密度圖的結合體。與箱形圖相比，小提琴圖顯而易見的優勢在于：除了顯示與箱形圖相同的統計數據外，它還顯示了數據的整體分布。在此，交互式的小提琴圖以其簡單的操作帶給我們更加直觀的視覺體驗，來體驗一下它有什么功能吧。
功能介紹
基于plotly插件的可交互式的小提琴圖繪制工具，適用于組別為2組及以上，組內有生物學重復的數據集，可展示多組數據的分布狀態以及概率密度，在數據量較大時比箱線圖更適用。
文件要求
01
特征豐度文件
例如alpha指數矩陣文件，第一列為樣本名稱，其余列為alpha多樣性指數，至少一列指數（特征）數據。
圖1 | 特征豐度文件格式示例
02
樣本分組信息文件
第一列為樣本名稱，需要與上述特征豐度文件中的樣本名稱一致，第二列為分組名稱，且表頭名稱必須為Sample及Group。
圖2 | 樣本分組信息文件格式示例
參數調整
01
主要參數
圖3 | 主要參數
02
常用參數
圖4 | 常用參數
作圖步驟
01
上傳文件
①請于主要參數中的特征豐度文件、樣本分組信息文件處上傳您所要進行分析的文件，如果此處未上傳文件，您將無法得出結果。上傳成功后，將會于“選擇文件”后顯示您上傳的文件名；
此處為上傳成功示例：
圖5 | 文件上傳成功示例
02
調整其他參數
①圖片標題：默認為Violin Plot，可接受默認或自行輸入；
②X軸標簽角度：默認為45，可接受默認或
③橫軸刻度字體大小、縱軸刻度字體大小、縱軸標題字體大小：可接受默認或自行輸入；
④字體類型：默認"Arial"，可在下拉菜單進行其他選擇；
⑤展示數據點：選擇是否在圖中展示數據點，當數據量較大時可選擇關閉。默認為“展示”，可在下拉菜單進行其他選擇；
⑥數據點大小：展示數據點的大小。默認為“7”，可接受默認或自行輸入；
⑦box配色方案：平臺共提供26種配色方案，包括多種期刊配色供您挑選。默認為“配色方案1”，可在下拉菜單進行其他選擇；
⑧注釋：用于結果的自定義標記，即歷史記錄中的注釋處，可接受默認或自行輸入。
03
最終提交
文件上傳成功后請
如圖所示區域：
圖6 | 工具預估耗時提示處
結果分析
01
結果展示
（圖片為使用示例文件及其他參數保持默認時的結果）
分析結果圖將會在此處展示，
圖7 | 結果展示處
02
交互式作圖
圖8 | 交互式界面
圖9 | 交互式界面可定制內容
圖10 | 交互式界面可定制內容
圖11 | 圖片全局風格調整項gif
圖12 | 圖例配置gif
圖13 | 標題設置gif
圖14 | X軸配置gif
圖15 | Y軸配置gif
圖16 | 樣本點調整gif
03
結果說明
5.3.1、小提琴圖
①小提琴圖中橫坐標為分組，縱坐標為指數（特征）數據；
②不同顏色的小提琴表示不同的分組；
③小提琴圖中心白色矩形的上底邊和下底邊代表該組特征值的上四分位數和下四分位數，中間橫線表示該組特征值的中位數；
④從小提琴圖中心白色矩形上底邊和下底邊延伸出去的兩條線段，其端點代表最大值和最小值（注意是非離群點的最大最小值）；
⑤小提琴圖中的黑點為數據點；
⑥外部形狀即為核密度估計，寬度即為頻率。較寬的部分代表觀測值取值的概率較高，較窄的部分則對應于較低的概率。
圖17 | 小提琴圖
歷史記錄
圖18 | 歷史記錄示例
請問對輸入文件的格式有什么要求呢？
您好，首先感謝您的咨詢。我們的小工具支持txt、xls、xlsx這幾種文件格式。
請問繪制小提琴圖對樣本數量有什么要求呢？
您好，首先感謝您的咨詢。小提琴圖適用于組別為2組及以上的數據集。
交互式作圖可以帶您更全面地了解各個層次的細節，定制您最稱心的個性化圖片。以上就是小提琴圖交互小工具的介紹，歐易云平臺正在開發更多的交互式小工具，期待您的試用反饋。
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