一文了解sgRNA(向導RNA)
向導RNA(guide RNA,gRNA),也稱為小向導RNA(small guide RNA,sgRNA)。是作用于動質體(kinetoplastid)體內一種稱為RNA編輯(RNA editing)的后轉錄修飾過程中。也是一種小型非編碼RNA。可與pre-mRNA配對,并在其中插入一些尿嘧啶(U),產生具有作用的mRNA。向導RNA編輯的RNA分子,長度大約是60~80個核苷酸,是由單獨的基因轉錄的,具有3'寡聚U的尾巴,中間有一段與被編輯mRNA精確互補的序列,5'端是一個錨定序列,它同非編輯的mRNA序列互補。
gRNA介導的RNA編
在編輯時,形成一個編輯體(editosome),以gRNAs內部的序列作為模板進行轉錄物的校正, 同時產生編輯的mRNA。gRNA3'端的oligo(U)尾可作為被添加的U的供體。
原核生物及植物線粒體中進行RNA編輯所需的RNA序列,是與正確編輯的RNA序列互補的一小段RNA,被用來作為向未經編輯的RNA中插入堿基的模板。
gRNA的分子結構
(1)在gRNA的5‘末端有一段錨定區,以特殊的G-U配對方式與pre-mRNA編輯序列互補,錨定序列促進gRNA與pre-mRNA中的編輯區互補,特異結合;
(2)在gRNA分子的中間部位也有一個編輯區負責在被編輯的pre-mRNA分子中插入U的位置;
(3)在gRNA分子的3’末端,有一段轉錄后加入的由大約15個非編碼的PolyU序列,功能為把gRNA鏈接到pre-mRNA的編輯區的5‘上游富含嘌呤堿基的核苷酸序列上。
-
科技前沿