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實(shí)時(shí)熒光定量PCR的Ct值的相關(guān)介紹

2022.3.11

  Ct值(Cycle threshold,循環(huán)閾值)的含義為:每個(gè)反應(yīng)管內(nèi)的熒光信號(hào)到達(dá)設(shè)定閾值時(shí)所經(jīng)歷的循環(huán)數(shù)

  1. 熒光閾值(threshold)的設(shè)定

  PCR反應(yīng)的前15個(gè)循環(huán)的熒光信號(hào)作為熒光本底信號(hào),熒光閾值的缺省(默認(rèn))設(shè)置是3-15個(gè)循環(huán)的熒光信號(hào)的標(biāo)準(zhǔn)偏差的10倍,即:threshold = 10*SDcycle 3-15

  2. Ct值與起始模板的關(guān)系

  每個(gè)模板的Ct值與該模板的起始拷貝數(shù)的對(duì)數(shù)存在線性關(guān)系,公式如下。

  Ct=-1/lg(1+Ex)*lgX0+lgN/lg(1+Ex)

  n為擴(kuò)增反應(yīng)的循環(huán)次數(shù),X0為初始模板量,Ex為擴(kuò)增效率,N為熒光擴(kuò)增信號(hào)達(dá)到閾值強(qiáng)度時(shí)擴(kuò)增產(chǎn)物的量。

  起始拷貝數(shù)越多,Ct值越小。利用已知起始拷貝數(shù)的標(biāo)準(zhǔn)品可作出標(biāo)準(zhǔn)曲線,其中橫坐標(biāo)代表起始拷貝數(shù)的對(duì)數(shù),縱坐標(biāo)代Ct值。因此,只要獲得未知樣品的Ct值,即可從標(biāo)準(zhǔn)曲線上計(jì)算出該樣品的起始拷貝數(shù)。

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