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HRM技術(shù)服務(wù)之SNP檢測(cè)

關(guān)鍵詞: HRM SNP 檢測(cè) DNA指紋來(lái)源: 互聯(lián)網(wǎng)

單核苷酸多態(tài)性(Single Nucleotide Polymorphisms,SNPs),指單個(gè)核苷酸堿基的改變,包括置換、顛換、缺失和插入,導(dǎo)致的核酸序列的多態(tài)性。在不同個(gè)體的同一條染色體或同一位點(diǎn)的核苷酸序列中,絕大多數(shù)核苷酸序列一致而只有一個(gè)堿基不同的現(xiàn)象,這就是SNP。SNP在人類基因組中數(shù)量較多,發(fā)生頻率較高,因此被認(rèn)為是繼微衛(wèi)星之后的新一代遺傳學(xué)標(biāo)記。

HRM檢測(cè)SNP技術(shù)是依據(jù)在一定的溫度范圍內(nèi)將PCR擴(kuò)增的產(chǎn)物進(jìn)行變性,期間實(shí)時(shí)檢測(cè)體系內(nèi)熒光信號(hào)。熒光值隨著溫度變化,可繪制溶解曲線。每一段DNA都有其獨(dú)特的序列,因而也就有了獨(dú)特的熔解曲線形狀,如同DNA指紋圖譜一樣,具有很高的特異性、穩(wěn)定性和重復(fù)性。根據(jù)曲線準(zhǔn)確區(qū)分野生型純合子、雜合子和突變性純合子(下圖)。

檢測(cè)SNP的方法有很多種。成本較低、通量較大的方法大都局限于已知、特定位點(diǎn),如Taqman探針?lè)?。既要?duì)已知位點(diǎn)分析又要查找未知位點(diǎn),一般采用PCR+測(cè)序的方法,成本高、操作繁復(fù)較低。

作為新一代的遺傳掃描工具,HRM技術(shù)是一種低成本、高通量、快速,且不受位點(diǎn)局限的檢測(cè)方法,是SNP篩查的最佳選擇。其具有"簡(jiǎn)、效、快、廉"等其他技術(shù)難以比擬的優(yōu)勢(shì):

簡(jiǎn):無(wú)需序列特異性探針,不受堿基位點(diǎn)局限,同時(shí)檢出已知或未知突變、SNP和甲基化位點(diǎn):閉管操作,避免交叉污染。

效:最低檢測(cè)0.1%-0,01%的突變或異常甲基化檢測(cè)SNP靈敏度和特異性均為100%。

快:1次同時(shí)不多于384個(gè)樣本,在60-90分鐘內(nèi)完成檢測(cè)。

廉:簡(jiǎn)化操作步驟、降低人工和試劑成本,費(fèi)用遠(yuǎn)少于測(cè)序、Taqman探針等方法。

HRM技術(shù)特別適用于樣本量多、檢測(cè)位點(diǎn)較少的SNP、突變或甲基化分析,是不同于基因芯片檢測(cè)方法(檢測(cè)位點(diǎn)多,樣本少)的高通量方法。同時(shí),也是基因芯片篩選后的多個(gè)基因在更多標(biāo)本中驗(yàn)證的最佳方法。

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