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安捷倫SureSelect靶向序列捕獲系統(tǒng)
安捷倫SureSelect靶向序列捕獲系統(tǒng)
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安捷倫SureSelect靶向序列捕獲系統(tǒng)

參考報價：面議 品牌：安捷倫 產(chǎn)地： 型號：解決高通量測序的費用瓶頸問題 樣本：來電或留言獲取樣本
AI問答
  • 可以做哪些實驗，檢測什么？ 可以用哪些耗材和試劑？
  • 多少錢一臺？ 參數(shù)細節(jié)是什么？
  • 使用的注意事項？ 操作規(guī)程？
產(chǎn)品介紹

安捷倫SureSelect靶向序列捕獲系統(tǒng)

 
解決研究中的費用瓶頸問題，發(fā)揮高通量測序的全部力量

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Nature Biotech封面文章：液相序列捕獲技術(shù)與高通量測序
 

安捷倫的SureSelect靶向序列捕獲系統(tǒng)可以顯著降低下一代測序技術(shù)（next-generation sequencing）的成本，并且可以極大程度的提高測序效率。SureSelect是一套基于安捷倫卓越的寡核苷酸合成技術(shù)的液相靶向序列捕獲系統(tǒng)，是一個適用于任何規(guī)模測序研究項目的可縮放平臺。完全不同于以往其它的序列捕獲方法，SureSelect系統(tǒng)僅僅需要3 µg的基因組DNA，這意味著研究者即使對珍貴樣本也可以進行高通量的平行靶向測序！
 
如圖1所示，SureSelect液相靶向序列捕獲系統(tǒng)操作流程非常簡單，絕大多數(shù)步驟都在微型離心管或者微孔板中進行，目前已經(jīng)可以和Illumina公司的基因組測序儀完美聯(lián)用。與其它下一代測序技術(shù)的主流廠商（Life Technologies and Roche）產(chǎn)品聯(lián)用的實驗方法，很快也將正式推出。依托于安捷倫杰出的免費在線設(shè)計平臺eArray（http://earray.chem.agilent.com/eArray）, 客戶可以靈活定制zei適合自身需求的序列捕獲系統(tǒng)。每套序列捕獲系統(tǒng)可以包含高達55，000條生物素標(biāo)記的RNA“誘餌”寡核苷酸序列。

 圖 1. SureSelect 靶向序列捕獲系統(tǒng)操作流程

 

借助eArray完成定制的序列捕獲系統(tǒng)，可能包含完全不同的RNA “誘餌”寡核苷酸序列，它們的表現(xiàn)又會怎樣？為了回答這個問題，安捷倫進行了大量的研究驗證工作。針對同一樣本的不同基因組序列區(qū)域，我們設(shè)計了多種不同的序列捕獲方案，進行多組平行對照實驗，利用測序結(jié)果中靶向序列讀出的比率作為富集效率的評判指標(biāo)。如圖2所示，8種不同的定制序列捕獲方案所獲得的靶向序列讀出的比率在40-80之間，意味著300-7400倍的富集效率，充分驗證了SureSelect系統(tǒng)的優(yōu)異表現(xiàn)。

 圖2. SureSelect靶向序列捕獲系統(tǒng)與定制設(shè)計策略

 

不管序列捕獲設(shè)計方法的特異性如何優(yōu)異，因為研究人員對基因組DNA進行隨機剪切，所以對靶向序列相鄰區(qū)域的捕獲仍然不能完全避免。但是，如圖2所示，安捷倫的SureSelect系統(tǒng)擁有極佳的序列捕獲特異性，對離開靶向序列區(qū)域200 bp以外的序列幾乎沒有捕獲。
 
衡量DNA測序技術(shù)的另外一個重要指標(biāo)是測序數(shù)據(jù)的覆蓋深度。較高的覆蓋深度，往往也意味著更好的辨識序列多態(tài)性的能力。圖3的測序結(jié)果表明，超過80的序列都可以獲得20x以上的覆蓋深度，因此完全可以輕松完成利用重新測序方法對基因組特定區(qū)域中SNP的辨識。
 
圖 3. SureSelect 靶向序列捕獲系統(tǒng)的覆蓋深度

 

產(chǎn)品信息
 

 

SureSelect液相系統(tǒng)

SureSelect固相系統(tǒng)

研究

10-1,000樣本

1-10 樣本

DNA起始量

1-3 µg

1-20 µg*

可捕捉的序列長度 （定制試劑盒。不收設(shè)計費）

6。6+ Mb

1+ Mb
 
 
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更多詳情，請訪問http://www.genomics.agilent.com/CollectionOverview.aspx?PageType=Application&SubPageType=ApplicationOverview&PageID=2094

 

安捷倫SureSelect靶向序列捕獲系統(tǒng)由安捷倫科技（中國）有限公司為您提供，如您想了解更多關(guān)于安捷倫SureSelect靶向序列捕獲系統(tǒng) 報價、型號、參數(shù)等信息，歡迎來電或留言咨詢。

注：該產(chǎn)品未在中華人民共和國食品藥品監(jiān)督管理部門申請醫(yī)療器械注冊和備案，不可用于臨床診斷或治療等相關(guān)用途。

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